先問是不是，再問為什麼。

題主所謂的“開國皇帝的廟號才可以稱祖”這個說法，根本就不成立。

事實是即使忽略掉明清兩朝，中國歷史上仍然有不少朝代，非開國或追尊皇帝也得以稱祖的，下面一一列出。

注: 西漢和東漢情況特殊，故不一起計算；但兩晉、後漢北漢、以及兩宋這種，都按照一個朝代來算。

1) 曹魏 - 烈祖曹叡，其實是第二任皇帝，開國皇帝是曹丕。

注: 更離譜的是這廟號曹叡生前就定好了。。。

三國志 卷3: 有司奏：武皇帝撥亂反正，為魏太祖，樂用武始之舞。文皇帝應天受命，為魏高祖，樂用鹹熙之舞。帝製作興治，為魏烈祖，樂用章武之舞。三祖之廟萬世不毀，其餕四廟親盡迭毀，如周後稷、文、武廟祧之制。

2) 晉朝 - 肅祖司馬紹，其實是第六任皇帝，開國皇帝是司馬炎。

晉書 卷6: 戊子，帝崩於東堂，年二十七，葬武平陵，廟號肅祖。

3) 後趙 - 太祖石虎，其實是第三任皇帝，開國皇帝是石勒。

晉書 卷107: 始葬季龍，號其墓為顯原陵，偽謚武皇帝，廟號太祖。

4) 後秦 - 高祖姚興，其實是第二任皇帝，開國皇帝是姚萸。

晉書 卷118: 義熙十二年，興死，時年五十一，在位二十二年。偽謚文桓皇帝，廟號高祖，墓曰偶陵。

5) 南朝宋 - 太祖劉義隆和世祖劉駿，其實分別是第三和第四任皇帝(不算劉劭的話)，開國皇帝是劉裕。

南史 卷2: 二月 Kōko，元兇劭構逆，帝崩於合殿，時年四十七。謚景皇帝，廟號中宗。三月癸巳，葬長寧陵。孝武帝踐阼，追改謚曰文帝，廟號太祖。

南史 卷2: 世祖孝武皇帝，諱駿，字休龍，小字道人，文帝第三子也。

6) 南朝齊 - 世祖蕭贖，其實是第二任皇帝，開國皇帝是蕭道成。

南史 卷4: 是日上崩於延昌殿，年五十四。群臣上謚曰武皇帝，廟號世祖。九月丙寅，葬景安陵。

7) 南朝梁 - 世祖蕭繹，其實是第四任皇帝，開國皇帝是蕭衍。

南史 卷8: 世祖孝元皇帝諱繹，字世誠，小字七符，武帝第七子也。

8) 南朝陳 - 世祖陳蒨，其實是第二任皇帝，開國皇帝是陳霸先。

南史 卷9: 六月 Kōshi，群臣上謚曰文皇帝，廟號世祖。丙寅，葬永寧陵。

9) 北魏 - 世祖拓跋燾、顯祖拓跋弘和高祖元巨集，其實分別是第三、第五和第六任皇帝(不算拓跋餘的話)，開國皇帝是拓跋珪。

魏書 卷4下: 三月甲寅，帝崩於永安宮，時年四十五。秘不發喪，中常侍宗愛矯皇后令，殺東平王翰，迎南安王餘入而立之，大赦，改元為永平，尊皇后赫連氏為皇太后。三月辛卯，上尊謚曰太武皇帝，葬於雲中金陵，廟號世祖。

魏書 卷6: 承明元年，年二十三，崩於永安殿，上尊謚曰獻文皇帝，廟號顯祖，葬雲中金陵。

魏書 卷7下: 夏四月丙午朔，帝崩於谷塘原之行宮，時年三十三。秘諱，至魯陽發哀，還京師。上謚曰孝文皇帝，廟曰高祖。五月丙申，葬長陵。

10) 北齊 - 世祖高湛，其實是第四任皇帝，開國皇帝是高洋。

北齊書 卷7: 天統四年十二月辛未，太上皇帝崩於鄴宮乾壽堂，時年三十二，謚曰武成皇帝，廟號世祖。五年二月甲申，葬於永平陵。

另外如果按割據君主而非皇帝計算的話，則前涼(張寔和張駿)、前燕(慕容皝和慕容儁)、前秦(苻健和苻堅)、西秦(乞伏乾歸和乞伏熾磐)、乃至楊吳(楊渥和楊隆演)也都有非開國君主稱祖的例子。

而如果康熙算清朝第四位皇帝的話，則代表題主視努爾哈赤為開國皇帝，那元朝的忽必烈也得算非開國皇帝稱祖了(鐵木真之於元，等同努爾哈赤之於清)。

或許題主想說的是大一統王朝“開國皇帝的廟號才可以稱祖”，但這其實也是個偽命題啊。

因為中國歷史上的帝國時代中(西元前221-1911年)，總共也就秦、西漢、新、東漢、晉、隋、唐、武周、元、明、清這十一個達成過大一統的王朝而已。

其中秦、新、隋和武周都非常短命，第一世或第二世就亡國了，根本沒條件給非開國皇帝封祖。

而且秦和新那時候還沒把廟號玩兒明白呢，秦朝更是連謚號都廢掉了。

PS: 且隋朝的東都朝廷(皇泰主楊侗)追封了楊廣為世祖，這個算的話則隋朝也有非開國皇帝稱祖現象的。

隋書 卷59: 宇文化及之弒逆也，文都等議，以侗元德太子之子，屬最為近，於是乃共尊立，大赦，改元曰皇泰。謚帝曰明，廟號世祖。追尊元德太子為孝成皇帝，廟號世宗。

和秦新前後腳的兩漢同理，廟號系統尚不成熟，甚至有些皇帝還沒有廟號或者被取消了廟號，沒什麼機會稱祖。

剩下的五個王朝裡，晉、明、清都有非開國皇帝稱祖，元朝其實也勉強可以算(按照清朝三祖的標準)。唯一的例外只有唐朝，可能因為他們把謚號玩兒出了花，沒空折騰廟號了吧哈哈。

綜上所述，題主的前提根本都不成立。更符合事實的說法應該是廟號從魏晉南北朝時期，就開始通貨膨脹了。

從這個角度，康熙被追為聖祖，雖然很水，但也沒什麼不可理解的。