兩者之間的區別有承擔的費用不同、繳費基數不同、繳費比例不同、補貼政策不同、退休年齡不同。
1.承擔的費用不同：靈活就業養老保險由個人承擔全額的社會保險費，職工養老是由企業繳納，養老保險費是企業和職工共同承擔的。
2.繳費基數不同：靈活就業人員的繳費基數可以根據自身情況選擇，繳費基數範圍一般為參保地上年度社會平均工資的60%-300%，大部分靈活就業參保人員為了減輕養老保險繳費壓力，會選擇按照最低繳費基數來繳納。單位職工所繳納養老保險繳費基數是根據職工本人月均工資確定的。
3.繳費比例不同：靈活就業養老保險繳費比例通常為20%左右，全部都由參保人員自己承擔，其中12%的繳費進入養老保險統籌賬戶當中，8%繳費進入到個人養老帳戶。單位職工養老保險繳費由單位和職工個人共同承擔，單位繳費比例目前大多為16%，個人繳費比例為8%左右，也就是說職工自己只需要承擔8%的繳費比例，個人所繳納的養老保險費用進入到養老保險個人賬戶當中。
4.補貼政策不同：國家為了促進職工就業，穩定就業困難人員的崗位。對於企業招納就業困難人員可以享受社保補貼，但是享受補貼的範圍僅限於企業負擔的社保部分。而靈活就業人員實現自我就業的話，這一部分錢是補給自己的，最高不超過個人負擔的2/3。
5.退休年齡不同：女性靈活就業退休年齡是55歲，也有部分靈活就業女性50歲就可退休。男性職工的退休年齡是60歲，女性職工是50歲，女幹部人員是55歲。