番茄修枝主要有單幹整枝和雙幹整枝的方法，可以根據實際的情況選擇整枝方法。單幹整枝需在第一穗果坐穩果後進行，把坐果枝以下的側枝全部剪除，等枝條再長出來後，可以再次剪除一次，反覆進行幾次。雙幹整枝是在番茄的花序長出來後，將主幹和花序下的側枝留下來，之後將植株上其餘的側枝剪掉。
1、单干整枝：在番茄的幼苗期，枝條生長雜亂，但是一些側枝會對根系生長有用，所以不適合隨便修剪。單幹整枝需在第一穗果坐穩果以後開始進行，把坐果枝以下的側枝全部剪除，等枝條再長出來後，可以再次剪除一次，反覆進行幾次。注意，為了保護番茄的主桿，在剪枝時，需留下一個1釐米長的斷樁。
2、双干整枝：在番茄的花序長出來後，將主幹和花序下的側枝留下來，之後將植株上其餘的側枝剪掉。通過對番茄的修剪，可以提高植株光合作用的效率，降低疾病出現的概率，促進後期生長。
3、注意事項：番茄可根據實際的情況選擇整枝方法，要注意及時綁蔓，還要摘掉枯黃葉子。
番茄在生長期間應做好水肥管理，它喜濕，應注意水分灌溉，保持土壤濕潤，但不能漬水。根據生長情況適當施肥，不可偏施氮肥，配合磷鉀肥，並且補充好各類微量元素。保持好溫度和濕度，高溫高濕的環境下應注意通風。及時疏花疏果，疏掉長勢不好的花果，也能利於坐果，提高番茄的品質。